تبنى خطة الأكاديمية الاستراتيجية على محورين أساسيين أولهما محور الأهداف الاستراتيجية وثانيهما محور الممكنات الاستراتيجية. ويتضمن المحور الأول الغايات الاستراتيجية التي تم صياغتها في ضوء رؤية ورسالة الأكاديمية والقيم الحاكمة للأداء خلال الفترة من 2021 إلى 2026.

تتضمن المحاور الاستراتيجية كل من الأهداف الاستراتيجية الخاصة بالتعليم والتعلم وصدارة التعليم البحرى والمكانة الدولية والمسئولية الاجتماعية. ولتحقيق تلك الغايات سوف يتم الاعتماد على مجموعة من الممكنات الاستراتيجية والتى تتضمن رأس المال الفكرى، التحول الرقمى، الإدارة والحوكمة والكفاءة المالية.